Denna sida dokumenterar arbete med systemintegrationer för LIS system.

Definition

Som regel använder regionerna specialiserade system för att hantera infromation som skapas i samband med laboratorieverksamhet. Dessa benämns i detta sammanhang som LIS för LaboratorieInformationsSystem. I och med att biobankning ofta sker i samband med analyser är det även allmänt så att det är i LIS som information om prov som bevaras i biobank dokumenteras. Det förekommer att även andra system används inom delområden där biobankning förekommer och rutiner för vad som primärdokumenteras i den allmänna patientjournalen respektive andra områdesspecifika system så som LIS varierar i någon grad mellan regioner. För läsbarhetens skull abstraheras dessa distinktioner bort i detta dokument och termen LIS representerar konceptuellt det system där infomration om bevarade prover primärt lagras och underhålls.

Det är för SBRs räkning aktuellt att bygga integrationer visavi regionernas LIS i syfte att uppnå de mål som regionerna har för den samverkan som ingåtts. Denna sida dokumenterar på en hög nivå de lösningsförslag som tagits fram och arbetet med att implementera dem.

Bakgrund

Biobank Sverige har inom ramen för regoinalt samverkan i uppdrag att utveckla system och annat stöd som hjälper regionerna att fullgöra de skyldigheter som följer av att man bevarar humant material i biobanker. Exempelvis finns i systemet katalogfunktioner för information om biobanker och provsamlingar, processtöd för hantering av domänspecika processer såsom samtyckesreglering och processtöd för ansökningsförvaranden.

...

Framtagande av specifikation för de krav regionerna ställer för att uppfylla ändamålen som provinformationen ska användas för görs tillsammans med regionernas kontaktpersoner för LIS-anslutningarna och utifrån tecknat samverkansavtal med tillhörande PM. Krav kring integration gentemot LIS-leverantörer Samverkansavtal

Historik

Det samverkansavtal som idag utgör grunden för utvecklingen av SBR föregås av ett likaledes gemensamt arbete med SBR men som utfördes i regi av Inera AB mellan 2009 och 2020. Redan i den tidigare versionen av SBR fanns en funktion för att importera data om bevarade prover som regelbundet exporterades från ett antal regioners LIS system. Lösningen byggde på ett gemensamt XML format för provinformation och en tjänst som läste in data fråm en XML-fil som överfördes periodiskt (typiskt dygnsvis).

...

När det nya SBR utvecklades inom ramen för regional samverkan utvecklades en tekniskt bakåtkompatibel lösning men där kravet på korrekt format stärktes och där mottagande hanterades transaktionellt säkert. Detta till trots kom ingen av de som tidigare exporterat data att kunna flytta befintliga exporter till den nya instansen av tjänsten.

Nytt lösningsförslag

Med utgångspunkt i de svårigheter som hindrat tidigare implementation fick BIS IT uppgift att ta fram ett lösningsförslag som är lättare att implementera för klineter men som samtidigt inte gör avkall på de krav som finns för den tänkta användningen.

...

Gemensamt för de båda lösningarna är sedan att de utgår från att begränsa teknikval till enklast möjliga nivåer av protokoll och att de givetvis bygger på öppna generiska standarder.

I och med att de största svårigheterna i tidigare försök kopplas till transaktioner och felhantering föreslås att tjänsten implementeras synkront. Detta för att förtydliga hanteringen av tillsåndsförändringar och minska lösningens komplexitet. Det kan behövas en annan ansats för en initial överföring men givet den volym prover som regelbundet sparas i vårdens biobanker är det inte ett tekniskt problem att överföra informationen med ett anrop per provtagning och omedelbart i samband med att det registrerats i lokalt LIS (som biobanksprov, givetvis). För att ytterligare förtydliga tillståndshantering införs en uttrycklig delete-operation som används för information om att ett prov förbrukats eller kasserats.

Förankring

Det lösningsförslag som utarbetats har presenerats för arkitekturråd hos Inera som fått representera regionernas gemensamma arbete med arkitekturfrågor för nationella tjänster. Den bedöming som gjordes kan sammanfattas med att det inte fanns alternativ inom pågående projekt som skulle kunna lösa användningsfallen eller att några sådana planerades. Framförallt var frågan om extensiva sökningar något som inte planerades för inom pågånede arbeten för utbyte av journalinformation.

Gemensamma möten med leverantörer av LIS system hölls med avsikt att få en återkoppling på om integrationsarkitekturen skulle vara ändamålsenlig att implementera. Leverantörer erbjöds även att offerera kostnad för implementation av nödvändiga funktioner för integrationen.

Lösningsförslag

De tekniska lösningar som föreslagits för att uppfylla ändamålen hittas här: API- och anslutningsbeskrivning för integration mot SBR och API för förfrågan om förekomst av prov och Föreslagen arkitektur

Kontaktpersoner

• Produktägare SBR (Hanna Fransson)

• Förvaltningsledare IT (Peter Hedman)

• Lagkrav och förutsättningar för SBR (Sonja Eaker Fält))

• Avtal och finansiering (Anna Beskow och Peter Hedman)

• Teknik och utveckling (Tomas Snäckerström och Christian Johansen)

• Samordna de olika delarna under RBC-SVIT (Christian Bruzelius)

• RBC - SVIT (införande stöd och support) (Christian Bruzelius)

Frågor och svar

Nedan samlar vi frågor som är återkommande från regioner, leverantörer och andra intressenter.

...