Bakgrund
SBR (Svenska Biobanksregistret) har två integrationer. En för att ta emot prov och tillhörande information i syfte att exponera denna för forskare (dels för feasibility, dels för att monitorera insamlingstakt i forskares egna studier) och verksamheten för kvalitetsutveckling, uppföljning och utbildning. API- och anslutningsbeskrivning för integration mot SBR
Den andra integrationen (som beskrivs här) används för att hitta prover för specifik person, antingen inom ramen för samtyckesförändringar eller för att hitta tidigare tagna prov som kan vara relevanta för personens eller anhörigs vård och behandling. Sökning på prov på individnivå kan också vara aktuellt för forskning exempelvis vid kliniska läkemedelsprövningar.
Den senare ställer mycket högre krav på datakvalitet och täckningsgrad, samtidigt som fokus är på förekomst av prov och inte nödvändigtvis på detaljer kring provet som är relevanta för att hitta prov för forskning. Detta gör att vi tagit fram två olika, kompletterande, sätt att integrera mot SBR.
Syfte
Integrationen har två syften:
Hitta prov för vilka provgivare vill förändra samtycke
När en provgivare vill förändra samtycke för ett prov utgår detta från var provet är taget (vilken huvudman). Provet kan dock skickas till andra huvudmän (antingen delar av provet eller provet i sin helhet). För att säkerställa att allt material hittas behöver därför samtliga enheter där provet kan förvaras kontaktas för att säkerställa att förfrågan hanteras korrekt. Idag finns ingen komplett tillgänglig strukturerad dokumentation kring vart prov skickas som kan utnyttjas för detta.
Det viktigaste är att kunna filtrera bort den majoritet av enheter som via denna integration kan garantera att de INTE har något prov givet de aktuella kriterierna för att på så sätt inte överbelasta enheterna med irrelevanta förfrågningar.Hitta prov för en persons vård och behandling
Som en del av en persons vård och behandling kan man ibland ha stor nytta av provmaterial taget tidigare. Dessa prov kan vara tagna var som helst i landet (och sedan distribuerats på samma sätt som i punkt 1).
Detta gör att vi behöver fråga varje enskild enhet huruvida de har prov från den aktuella personen för att på så sätt kunna presentera för behandlande läkare var det finns prov, var det kanske finns prov och var det inte finns prov, så att denne kan fortsätta processen genom kontakt med relevanta enheter.
Sökning på prov på individnivå kan också vara aktuellt för forskning exempelvis vid kliniska läkemedelsprövningar.
Generella principer
Integration mot Svenska Biobanksregistret (SBR) kan göras på två olika sätt.
Överföring av data kring biobanksprov till respektive huvudmans del i SBR (mellanlagring)
Slagningar mot LIS-system på enskilda individer från SBR när frågan uppstår
Dessa står inte emot varandra, utan ska ses som två olika möjligheter att uppnå samma mål.
Den första lösningen möjliggör också framtida funktioner för att göra forskningssökningar baserat på egenskaper hos provet.
Integrationen är byggd med REST och skyddas av certifikat. Frågor ställs på på personnivå från SBR till respektive LIS-system.
Om inte SBR får ett korrekt svar tillbaka kommer detta tydligt att visas i gränssnittet. Endast vid korrekta svar (oavsett innehåll) kommer svaret att visas upp för användaren.
...